S/MIME מגדיר אמצעי להפיכת הודעות הדואר האלקטרוני ליותר מוגנות ע"י הוספת גם חתימות דיגיטליות וגם הצפנה. ע"י שימוש בחבילות דואר אלקטרוני S/MIME , משתמשים יכולים לוודא כי ההודעה אכן מגיעה מהשולח המשוער (הודות לחתימה), ושאף אחד אחר לא יכל לקרוא את ההודעה לפני הגעתה (הודות להצפנה).