וירוסים אלה משתמשים בשילוב של טכניקות כולל הדבקת מסמכים, תוכניות להרצה ומגזרי האתחול. מרבית הוירוסים הרב-חלקיים הופכים לתושבי-זיכרון ואז מדביקים את מגזר האתחול בדיסק הקשיח. ברגע שוירוס זה מגיע לזיכרון, הוא יכול להדביק את המערכת כולה.
הרחקת וירוס רב-חלקי דורשת חיטוי מגזר האתחול וכל הקבצים הנגועים. לתיקון המצב יש להשתמש בדיסק ההצלה מוגן כתיבה (מצב בו לא ניתן לכתוב על הדיסקט).