וירוסים שותפים משתמשים בתכונה של מערכת ההפעלה DOS המאפשרת לתכניות עם שם זהה אך סיומות (extension) שונות לפעול בעדיפויות שונות. מרבית הוירוסים השותפים יוצרים קובץ COM שעדיפותו גבוהה יותר מקובץ EXE הקיים בשם זהה.
לדוגמא, הוירוס יכול למצוא קובץ בשם PROGRAM.EXE וליצור קובץ בשם PROGRAM.COM. כאשר המחשב מפעיל הקובץ PROGRAM משורת הפקודה, הוירוס (PROGRAM.COM) רץ לפני התכנית הרצויה (PROGRAM.EXE). לרוב, הוירוס יבצע את התכנית המקורית מייד לאחר הרצתו כדי שהמערכת תיראה תקינה.